| 13．國立競技場站 |
| 國立競技場站（日语：国立競技場駅／こくりつきょうぎじょうえき Kokuritsu-kyōgijō eki */?）位於日本東京都新宿區霞丘町，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 25。副站名為「東京體育館前」。
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| 14．曙橋站 |
| 曙橋站（日语：曙橋駅／あけぼのばしえき Akebonobashi eki */?）是位於日本東京都新宿區住吉町，屬於東京都交通局（都營地下鐵）新宿線的鐵路車站。車站編號是S 03。
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| 15．市谷站 |
| 市谷站（日语：市ケ谷駅／いちがやえき Ichigaya eki */?）是位於日本東京都千代田區、新宿區，屬於東日本旅客鐵道（JR東日本）、東京地下鐵、東京都交通局（都營地下鐵）的鐵路車站。
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| 16．牛込神樂坂站 |
| 牛込神樂坂站（日语：牛込神楽坂駅／うしごめかぐらざかえき Ushigome-kagurazaka eki */?）是位於日本東京都新宿區箪笥町，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 05。
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| 17．牛込柳町站 |
| 牛込柳町站（日语：牛込柳町駅／うしごめやなぎちょうえき Ushigome-yanagichō eki */?）是位於日本東京都新宿區原町二丁目，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 04。
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| 18．大久保站 (東京都) |
| 大久保站（日语：大久保駅／おおくぼえき Ōkubo eki */?）是位於日本東京都新宿區百人町一丁目，屬於東日本旅客鐵道（JR東日本）中央本線的鐵路車站。車站編號是JB 09。JR東日本車站服務（日语：JR東日本ステーションサービス）受托的業務委托站。
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| 19．落合站 (東京都) |
| 落合站（日语：落合駅／おちあいえき Ochiai eki */?）是位於日本東京都新宿區上落合二丁目，屬於東京地下鐵東西線的鐵路車站。車站編號是T 02。
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| 20．落合南長崎站 |
| 落合南長崎站（日语：落合南長崎駅／おちあいみなみながさきえき Ochiai-minami-nagasaki eki */?）是位於日本東京都新宿區西落合三丁目，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 33。
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| 21．面影橋停留場 |
| 面影橋停留場（日语：面影橋停留場／おもかげぱしていりゅうじょ Omokagebashi teiryūjo */?）是一個位於東京都新宿區西早稻田三丁目的新目白通上，屬於荒川線的停留場。停留場名來自跨過神田川的橋樑之名。
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| 22．神樂坂站 |
| 神樂坂站（日语：神楽坂駅／かぐらざかえき Kagurazaka eki */?）是位於日本東京都新宿區矢來町，屬於東京地下鐵東西線的鐵路車站。車站編號是T 05。
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| 23．信濃町站 |
| 信濃町站（日语：信濃町駅／しなのまちえき Shinanomachi eki */?）是位於日本東京都新宿區信濃町，屬於東日本旅客鐵道（JR東日本）中央本線的鐵路車站。車站編號是JB 13。
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| 24．下落合站 |
| 下落合站（日语：下落合駅／しもおちあいえき Shimo-ochiai eki */?）是位於日本東京都新宿區下落合一丁目，屬於西武鐵道新宿線的鐵路車站。車站編號是SS03。
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| 25．新大久保站 |
| 新大久保站（日语：新大久保駅／しんおおくぼえき Shin-ōkubo eki */?）是位於日本東京都新宿區百人町一丁目，屬於東日本旅客鐵道（JR東日本）山手線的鐵路車站。車站編號是JY 16。
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| 26．新宿御苑前站 |
| 新宿御苑前站（日语：新宿御苑前駅／しんじゅくぎょえんまええき Shinjuku-gyoemmae eki */?）是一個位於東京都新宿區新宿一丁目，屬於東京地下鐵丸之內線的鐵路車站。車站編號是M 10。
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| 27．新宿三丁目站 |
| 新宿三丁目站（日语：新宿三丁目駅／しんじゅくさんちょうめえき Shinjuku-sanchōme eki */?）是位於日本東京都新宿區新宿，屬於東京地下鐵、東京都交通局（都營地下鐵）的鐵路車站。
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| 28．新宿西口站 |
| 新宿西口站（日语：新宿西口駅／しんじゅくにしぐちえき Shinjuku-nishiguchi eki */?）是位於日本東京都新宿區西新宿一丁目，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 01，雖然帶有「01」，但從來沒有任何列車在此站始發（所有列車都在相鄰的都廳前站（E 28）始發）。
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| 29．西武新宿站 |
| 西武新宿站（日语：西武新宿駅／せいぶしんじゅくえき Seibu-shinjuku eki */?）是位於日本東京都新宿區歌舞伎町一丁目，屬於西武鐵道新宿線的鐵路車站。此站是該線的起點，車站編號是SS01[2]。
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| 30．高田馬場站 |
| 高田馬場站（日语：高田馬場駅／たかだのばばえき Takadanobaba eki */?）是位於日本東京都新宿區高田馬場一丁目，屬於東日本旅客鐵道（JR東日本）、西武鐵道、東京地下鐵的鐵路車站。
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| 31．都廳前站 |
| 都廳前站（日语：都庁前駅／とちょうまええき Tochōmae eki */?）是位於日本東京都新宿區西新宿二丁目，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的地鐵車站，亦是該線的起點站。車站編號是E 28。
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| 32．中井站 |
| 中井站（日语：中井駅／なかいえき Nakai eki */?）是位於日本東京都新宿區，屬於西武鐵道、東京都交通局（都營地下鐵）的鐵路車站。
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| 33．西新宿站 |
| 西新宿站（日语：西新宿駅／にししんじゅくえき Nishi-shinjuku eki */?）是位於日本東京都新宿區西新宿六丁目，屬於東京地下鐵丸之內線的鐵路車站。
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| 34．西新宿五丁目站 |
| 西新宿五丁目站（日语：西新宿五丁目駅／にししんじゅくごちょうめえき Nishi-shinjuku-gochōme eki */?）是位於日本東京都新宿區西新宿五丁目，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 29。副站名「清水橋」。站名的日語假名長12字，是東京的地下鐵系統當中最長的車站。
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| 35．西早稻田站 |
| 西早稻田站（日语：西早稲田駅／にしわせだえき Nishi-waseda eki */?）是位於日本東京都新宿區戶山三丁目，屬於東京地下鐵副都心線的鐵路車站。車站編號是F 11。
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| 36．東新宿站 |
| 東新宿站（日语：東新宿駅／ひがししんじゅくえき Higashi-shinjuku eki */?）是位於日本東京都新宿區新宿七丁目，屬於東京都交通局（都營地下鐵）、東京地下鐵的鐵路車站。車站開設後，公寓落成提高了使用人數，2012年又興建了與商業複合型的辦公大樓「新宿東城廣場（日语：新宿イーストサイドスクエア）」的連結通道，集合了車站東部居民的生活交流設施，進行再開發。
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| 37．四谷站 |
| 四谷站（日语：四ツ谷駅／よつやえき Yotsuya eki */?）是位於日本東京都新宿區四谷一丁目，屬於東日本旅客鐵道（JR東日本）、東京地下鐵的鐵道車站。車站的站址位於區界上，JR東日本的大部分站體以及東京地下鐵丸之內線的一部分站體位於千代田区麹町六丁目。
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| 38．四谷三丁目站 |
| 四谷三丁目站（日语：四谷三丁目駅／よつやさんちょうめえき Yotsuya-sanchōme eki */?）是位於日本東京都新宿區四谷三丁目，屬於東京地下鐵丸之內線的鐵路車站。車站編號是M 11。
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| 39．若松河田站 |
| 若松河田站（日语：若松河田駅／わかまつかわだえき Wakamatsu-kawada eki */?）是位於日本東京都新宿區河田町，屬於東京都交通局（都營地下鐵）大江戶線的鐵路車站。車站編號是E 03。
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| 40．早稻田站 |
| 早稻田站（日语：早稲田駅／わせだえき Waseda eki */?）是位於日本東京都新宿區早稻田南町，屬於東京地下鐵東西線的鐵路車站。車站編號是T 04。
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| 41．早稻田停留場 |
| 早稻田停留場（日语：早稲田停留場／わせだていりゅうじょ Waseda teiryūjo */?）是一個位於東京都新宿區西早稻田一丁目的新目白通（日语：新目白通り）上，屬於荒川線的停留場。同時也是該線的終點。
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