| 1．藤古川 |
| 藤古川（ふじこがわ）は、木曽川水系の一級河川。滋賀県米原市、岐阜県不破郡関ケ原町・大垣市を流れる。牧田川・揖斐川を経て伊勢湾に至る木曽川の3次支川[1][2]。 |
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| 2．姉川 |
| 姉川（あねがわ）は、日本の滋賀県北部を流れる淀川水系の一級河川。 |
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| 3．天野川 (滋賀県) |
| 天野川（あまのがわ）は、滋賀県の琵琶湖に注ぐ一級河川の一つ。 |
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| 4．石田川 (滋賀県) |
| 石田川（いしだがわ）は、滋賀県北西部を流れて琵琶湖に注ぐ川である。淀川水系の一級河川。 |
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| 5．犬上川 |
| 犬上川（いぬかみがわ）は、滋賀県東部（湖東地域）を流れる淀川水系の一級河川。 |
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| 6．宇曽川 |
| 宇曽川（うそがわ）は、滋賀県東部（湖東地域）を流れる淀川水系の一級河川。 |
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| 7．愛知川 |
| 愛知川（えちがわ）は、滋賀県東部（湖東地域）を流れる淀川水系の一級河川。 |
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| 8．鴨川 (滋賀県) |
| 鴨川（かもがわ）は、滋賀県の西部を流れる一級河川で、琵琶湖に流入する淀川水系の河川。 |
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| 9．草津川 |
| 草津川（くさつがわ）は、滋賀県を流れる淀川水系の一級河川である。下流部分は典型的な天井川であり度重なる災害をもたらしていたが、2002年7月、治水事業として中流域から琵琶湖にかけての草津川放水路が開削されたため、天井川を成していた旧河道は廃川となった。従来の流路を旧草津川とも称する。 |
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| 10．草野川 |
| 草野川（くさのがわ）は、滋賀県長浜市を流れる淀川水系の河川。姉川の支流である。 河川の起点は滋賀県長浜市高山町の一の瀬、蛇谷。長浜市高山町の山中に発する東俣谷と西俣谷が合わさり南流、飯山口で谷を出てから南西流し長浜市宮部町で姉川に合流する。 上流部の長浜市上草野地区は豪雪地帯である。 清流として知られ、また漁業権が設定されている。草野川漁業協同組合がニジマスを放流しており、入漁料を支払うことで釣りを楽しめる。 |
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| 11．相模川 (滋賀県) |
| 相模川（さがみがわ）は、滋賀県大津市を流れ琵琶湖に注ぐ淀川水系の一級河川。 江戸時代には膳所藩の手により何度かの付替え工事がなされた。現在は滋賀県大津市膳所池ノ内町に源を発し北流、大津市におの浜と大津市由美浜の境界で琵琶湖に注ぐ。一級河川としての起点は滋賀県大津市膳所平尾町で区間長は2.3km。頻発する洪水被害の対策のため名神高速道路に沿って瀬田川に直接放流する大津放水路と呼ばれる地下トンネルへの、第２期工事による接続が計画されている。 座標: 北緯35度0分18秒 東経135度53分24.7秒 / 北緯35.00500度 東経135.890194度 / 35.00500; 135.890194 |
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| 12．芹川 (滋賀県) |
| 芹川（せりかわ）は、滋賀県東部（湖東地域）を流れる淀川水系の一級河川。「善利川」とも表記される。 |
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| 13．杣川 |
| 杣川（そまがわ）は、滋賀県甲賀市を流れる淀川水系の一級河川。古くは油日川や矢川などと呼ばれていたが、現在はこの名が定着している。 |
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| 14．大戸川 |
| 大戸川（だいどがわ）は、滋賀県南部を流れる淀川水系の一級河川。 |
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| 15．高時川 |
| 高時川（たかときがわ、別名：妹川（いもうとがわ））は、滋賀県長浜市を流れる淀川水系の河川。姉川の支流である。上流部では丹生川と呼ばれており、また一部の流域の住民は姉川に対して、高時川を妹川とも呼ぶ。 |
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| 16．日野川 (滋賀県) |
| 日野川（ひのがわ）は、滋賀県中部（湖東地域）を流れる淀川水系の一級河川。 |
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| 17．百瀬川 |
| 百瀬川（ももせがわ）は、滋賀県高島市内を流れる一級河川。 |
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| 18．野洲川 |
| 野洲川（やすがわ）は、滋賀県を流れる淀川水系の一級河川。琵琶湖への流入河川では最長である。 |
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| 19．余呉川 |
| 余呉川（よごがわ）は、滋賀県長浜市を流れる淀川水系の一級河川。 |
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