| 1．朝地站 |
| 朝地站（日语：朝地駅／あさじえき Asaji eki */?）是一個位於大分縣豐後大野市朝地町坪泉、屬於九州旅客鐵道（JR九州）豐肥本線的鐵路車站[1]。
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| 2．浅海井站 |
| 淺海井站（日语：浅海井駅／あざむいえき Azamui eki */?）是一個位於大分縣佐伯市上浦大字淺海井浦、屬於九州旅客鐵道（JR九州）日豐本線的鐵路車站。
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| 3．天瀨車站 |
| 天瀨站（日语：天ヶ瀬駅／あまがせ Amagase eki */?）是日本大分縣日田市的一個鐵路車站，位於久大本線，由九州旅客鐵道（JR九州）營運。[4][5]
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| 4．犬飼站 |
| 犬飼站（日语：犬飼駅／いぬかいえき Inukai eki */?）是位於大分縣豐後大野市犬飼町下津尾，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。曾經急行「火之山」停靠此站[4]。
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| 5．今津站 (大分縣) |
| 今津站（日语：今津駅／いまづえき Imazu eki */?）是位於大分縣中津市大字今津字古屋，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 6．今山站 |
| 今山站（日语：今山駅／いまやまえき Imayama eki */?）是位於大分縣日田市大字友田，九州旅客鐵道（JR九州）的日田彥山線車站[1]。
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| 7．臼杵站 |
| 臼杵站（日语：臼杵駅／うすきえき Usuki eki */?）是位於大分縣臼杵市添，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920538[4]。此站為臼杵市中心車站，所有列車停站。大約半數普通列車於此站折返往大分方向。本站是由JR九州服務支援（日语：JR九州サービスサポート）管理的業務委託車站[3]，設有綠色窗口。
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| 8．惠良站 |
| 惠良站（日语：恵良駅／えらえき Era eki */?）是位於大分縣玖珠郡九重町大字右田，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 9．大神站 |
| 大神站（日语：大神駅／おおがえき Ōga eki */?）是位於大分縣速見郡日出町大字大神，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 10．大鶴站 |
| 大鶴站（日语：大鶴駅／おおつるえき Ōtsuru eki */?）是位於大分縣日田市大字友田，九州旅客鐵道（JR九州）的日田彥山線車站[1]。
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| 11．緒方站 |
| 緒方站（日语：緒方駅／おがたえき Ogata eki */?）是位於大分縣豐後大野市緒方町馬場，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 12．鬼瀨站 |
| 鬼瀨站（日语：鬼瀬駅／おにがせえき Onigase eki */?）是位於大分縣由布市挾間町鬼瀨，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 13．小野屋站 |
| 小野屋站（日语：小野屋駅／おのやえき Onoya eki */?）是位於大分縣由布市挾間町鬼瀨，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 14．海崎站 |
| 海崎站（日语：海崎駅／かいざきえき Kaizaki eki */?）是位於大分縣佐伯市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站，現時為無人車站。
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| 15．上臼杵站 |
| 上臼杵站（日语：上臼杵駅／かみうすきえき Kami-Usuki eki */?）是位於大分縣臼杵市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站，現時為無人車站。車站位於市中心的西南方邊沿，與臼杵市中心距離較遠，但多為住宅，亦設有購物中心，所以仍有一定的人客量。
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| 16．上岡站 |
| 上岡站（日语：上岡駅／かみおかえき Kamioka eki */?）是位於大分縣佐伯市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站，為無人車站。
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| 17．龜川站 |
| 龜川站（日语：亀川駅／かめがわえき Kamegawa eki */?）是位於大分縣別府市龜川濱田町，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920533[5]。
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| 18．狩生站 |
| 狩生站（日语：狩生駅／かりうえき Kariu eki */?）是位於大分縣佐伯市，屬九州旅客鐵道（JR九州）日豐本線的車站，現時為無人站。
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| 19．川原木信號場 |
| 川原木信號場（日语：川原木信号場／かわらぎしんごうじょう Kawaragi-shingōjō */?）是一位於日本大分縣佐伯市、隸屬於九州旅客鐵道（JR九州）的鐵路設施，此信號場十分接近國道10號，可乘坐大分巴士於「岸之上」巴士站下車，再向山邊方向即可到達。
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| 20．北山田站 (大分縣) |
| 北山田站（日语：北山田駅／きたやまだえき Kitayamada eki */?）是位於大分縣玖珠郡玖珠町大字戶畑，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 21．杵築站 |
| 杵築站（日语：杵築駅／きつきえき Kitsuki eki */?）是位於大分縣杵築市大字八坂野添，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920518[5]。部分特急「日輪」「日輪喜凱亞」和「音速」停站。另外，由小倉或大分開出的部分快速及普通列車亦以本站為區間起訖站。
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| 22．熊崎站 |
| 熊崎站（日语：熊崎駅／くまさきえき Kumasaki eki */?）是位於大分縣臼杵市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。原為直營站，但由於為了削減鐵道事業赤字，在2015年3月14日隨時間表改正中而變成無人車站[3][4]。
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| 23．佐伯站 |
| 佐伯站（日语：佐伯駅／さいきえき Saiki eki */?）是位於大分縣佐伯市站前二丁目6-35，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920544[3]。是佐伯市的中心車站，停靠所有級別停站。特急「日輪」及1班「音速」連接本站及博多站，而由福岡縣或大分站開出的普通列車亦全以本站為終點站。而本站～延岡之間的路段為整條日豐本線中普通班次最疏的路段，一日只開出3來回，其中2來回更只止於重岡，因此往延岡的班次被稱為「全日本最早開出的末班車」。
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| 24．佐志生站 |
| 佐志生站（日语：佐志生駅／さしうえき Sashiu-eki */?）是一個位於日本大分縣臼杵市，由九州旅客鐵道營運的日豐本線鐵路車站[2]，現時為無人車站。車站從大分站起再次進入山嶺部份，而車站亦位於大字中的西南邊沿部份，遠離國道217號（日语：国道217号）（大約1公里）及佐志生中心區之餘（大約1.5公里），步行距離約為15分鐘，車站附近民居亦十分稀疏，因此使用量頗低。
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| 25．重岡站 |
| 重岡站（日语：重岡駅／しげおかえき Shigeoka eki */?）是位於大分縣佐伯市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 26．下之江站 |
| 下之江站（日语：下ノ江駅／したのええき Shitanoe eki */?）是位於大分縣臼杵市，屬於九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站，現由臼杵站管理的無人車站。
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| 27．庄內站 (大分縣) |
| 庄內站（日语：庄内駅／しょうないえき Shōnai eki */?）是位於大分縣由布市庄內町西長寶，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 28．菅尾站 |
| 菅尾站（日语：菅尾駅／すがおえき Sugao eki */?）是位於大分縣豐後大野市三重町淺瀨，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 29．杉河内站 |
| 杉河內站（日语：杉河内駅〔杉河內驛〕／すぎかわちえき Sugikawachi eki */?）是位於日本大分縣日田市天瀨町赤岩的九州旅客鐵道鐵路車站。
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| 30．宗太郎站 |
| 宗太郎站（日语：宗太郎駅／そうたろうえき Sōtarō eki */?）是位於大分縣佐伯市，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站，是著名的鐵路迷秘境車站[2][3]。
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| 31．高城站 (日本) |
| 高城站（日语：高城駅／たかじょうえき Takajō eki */?）是位於大分縣大分市高城新町，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1][2]。
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| 32．立石站 |
| 立石站（日语：立石駅／たていしえき Tateishi eki */?）是位於大分縣杵築市山香町大字立石，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。此站與鄰站中山香站之間為單線[1]。
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| 33．玉來站 |
| 玉來站（日语：玉来駅／たまらいえき Tamarai eki */?）是位於大分縣竹田市大字玉來，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 34．津久見站 |
| 津久見站（日语：津久見駅／つくみえき Tsukumi eki */?）是位於大分縣津久見市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920539[3]。現時由JR九州服務支援（日语：JR九州サービスサポート）管理的業務委託車站[2]，設有綠色窗口。
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| 35．光岡站 |
| 光岡站（日语：光岡駅／てるおかえき Teruoka eki */?）是位於大分縣日田市大字友田，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 36．天神山站 |
| 天神山站（日语：天神山駅／てんじんやまえき Tenjinyama eki */?）是位於大分縣由布市庄內町西長寶，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 37．直川站 |
| 直川站（日语：直川駅／なおかわえき Naokawa eki */?）是位於大分縣佐伯市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。現時為無人車站，並只提供每3來回的班次。
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| 38．直見站 |
| 直見站（日语：直見駅／なおみえき Naomi eki */?）是位於大分縣佐伯市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。現時為無人車站，並只提供每3來回的班次。
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| 39．中津站 (大分縣) |
| 中津站（日语：中津駅／なかつえき Nakatsu eki */?）是位於大分縣中津市大字島田，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。為大分縣最北端的車站。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920512[3]。
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| 40．中山香站 |
| 中山香站（日语：中山香駅／なかやまがえき Naka-Yamaga eki */?）是位於大分縣杵築市山香町大字野原字宮之原，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920517[4]。
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| 41．野矢站 |
| 野矢站（日语：野矢駅／のやえき Noya eki */?）是位於大分縣玖珠郡九重町大字野上字上恒406番地，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 42．東中津站 |
| 東中津站（日语：東中津駅／ひがしなかつえき Higashi-Nakatsu eki */?）是位於大分縣中津市大字是則字古開，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 43．東別府站 |
| 東別府站（日语：東別府駅／ひがしべっぷえき Higashi-Beppu eki */?）是位於大分縣別府市濱脇一丁目，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[4]。
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| 44．引治站 |
| 引治站（日语：引治駅／ひきじえき Hikiji eki */?）是位於大分縣玖珠郡九重町大字町田，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 45．日出站 |
| 日出站（日语：日出駅／ひじえき Hiji eki */?）是位於大分縣速見郡日出町字佐尾，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 46．日代站 |
| 日代站（日语：日代駅／ひしろえき Hishiro eki */?）是位於大分縣津久見市，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]，現時為無人車站[2]。
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| 47．日田站 |
| 日田站（日语：日田駅／ひたえき Hita eki */?）是位於大分縣日田市元町，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。為日田市的代表車站。
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| 48．豐後荻站 |
| 豐後荻站（日语：豊後荻駅／ぶんごおぎえき Bungo-Ogi eki */?）是位於大分縣竹田市荻町馬場，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。離開此站前往熊本方向的路軌會越過縣境進入熊本縣。
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| 49．豐後清川站 |
| 豐後清川站（日语：豊後清川駅／ぶんごきよかわえき Bungo-Kiyokawa eki */?）是位於大分縣豐後大野市清川町雨堤，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 50．豐後竹田站 |
| 豐後竹田站（日语：豊後竹田駅／ぶんごたけたえき Bungo-Taketa eki */?）是位於大分縣竹田市大字會會，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 51．豐後豐岡站 |
| 豐後豐岡站（日语：豊後豊岡駅／ぶんごとよおかえき Bungo-Toyooka eki */?）是位於大分縣速見郡日出町大字豊岡，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 52．豐後中川站 |
| 豐後中川站（日语：豊後中川駅／ぶんごなかがわえき Bungo-Nakagawa eki */?）是位於大分縣日田市天瀨町合田，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 53．豐後中村站 |
| 豐後中村站（日语：豊後中村駅／ぶんごなかむらえき Bungo-Nakamura eki */?）是位於大分縣玖珠郡九重町大字右田，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 54．豐後三芳站 |
| 豐後三芳站（日语：豊後三芳駅／ぶんごみよしえき Bungo-Miyoshi eki */?）是位於大分縣日田市天瀨町合田，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 55．豐後森站 |
| 豐後森站（日语：豊後森駅／ぶんごもりえき Bungo-Mori eki */?）是位於大分縣玖珠郡玖珠町大字帆足245番5號，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 56．別府車站 (大分縣) |
| 別府站（日语：別府駅／べっぷえき Beppu eki */?）位於日本大分縣別府市驛前町，隸屬九州旅客鐵道（JR九州）日豐本線，是距離别府温泉景區最近的車站。
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| 57．別府大學站 |
| 別府大學站（日语：別府大学駅／べっぷだいがくえき Beppudaigaku eki */?）是位於大分縣別府市上人濱町，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 58．三重町站 |
| 三重町站（日语：三重町駅／みえまちえき Miemachi eki */?）是位於大分縣豐後大野市三重町赤嶺，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 59．南由布站 |
| 南由布站（日语：南由布駅／みなみゆふえき Minami-Yufu eki */?）是位於大分縣由布市湯布院町中川，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線車站[1]。
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| 60．向之原站 |
| 向之原站（日语：向之原駅／むかいのはるえき Mukainoharu eki */?）位于大分县由布市挟间町向原，是九州旅客铁道（JR九州）的鐵路車站[1]。
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| 61．湯平站 |
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| 62．由布院站 |
| 由布院站（日语：由布院駅／ゆふいんえき Yufuin eki */?）位于大分县由布市汤布院，是九州旅客铁道（JR九州）的鐵路車站[1]。
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| 63．夜明站 |
| 夜明站（日语：夜明駅／よあけえき Yoake eki */?）是位於大分縣日田市大字夜明1802番地，九州旅客鐵道（JR九州）的久大本線和日田彥山線車站[1]。
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| 64．暘谷站 |
| 暘谷站（日语：暘谷駅／ようこくえき Yōkoku eki */?）是位於大分縣速見郡日出町，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。因日出町役場在本站南端附近，亦有連接三麗鷗和諧樂園（日语：ハーモニーランド）（Sanrio Harmonyland）的巴士服務，使它成為了日出町的中心車站。然而本站卻只停靠普通列車，所有特急列車在日出町內均全數通過不停靠。
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| 65．天津站 (日本) |
| 天津站（日语：天津駅／あまつえき Amatsu eki */?）位於大分縣宇佐市大字下敷田字繩夏期365番地，隸屬九州旅客鐵道（JR九州）日豐本線。
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| 66．宇佐車站 |
| 宇佐站（日语：宇佐駅／うさえき Usa eki */?）位於日本大分縣宇佐市大字岩崎，隸屬九州旅客鐵道（JR九州）日豐本線。是距離宇佐神宮最近的車站（直線距離約3.5公里）。
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| 67．西屋敷站 |
| 西屋敷站（日语：西屋敷駅／にしやしきえき Nishiyashiki eki */?）是位於大分縣宇佐市大字西屋敷，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 68．豐前善光寺站 |
| 豐前善光寺站（日语：豊前善光寺駅／ぶぜんぜんこうじえき Buzen-Zenkōji eki */?）是位於大分縣宇佐市大字東高家，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。
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| 69．豐前長洲站 |
| 豐前長洲站（日语：豊前長洲駅／ぶぜんながすえき Buzen-Nagasu eki */?）是位於大分縣宇佐市大字長洲字小黑，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。
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| 70．柳浦站 |
| 柳浦站（日语：柳ケ浦駅／やなぎがうらえき Yanagigaura eki */?）是位於大分縣宇佐市住吉町1丁目，九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920512[2]。
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| 71．大分站 |
| 大分站（日语：大分駅〔大分驛〕／おおいたえき Ōita eki */?）是位於日本大分縣大分市要町1番1號的九州旅客鐵道鐵路車站。為大分縣縣廳所在地，亦是大分市的的代表車站。2021年度日均乘車人數達15,427人，是九州島內第4位最多人使用車站、最多人使用的非新幹線車站[4]。
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| 72．大分大學前站 |
| 大分大學前站（日语：大分大学前駅／おおいただいがくまええき Ōitadaigakumae eki */?）是位於大分縣大分市大字旦野原，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 73．大在站 |
| 大在站（日语：大在駅／おおざいえき Ōzai eki */?）是位於大分縣大分市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。現時為業務委託站[2]，每天有兩班上行及一班下行的特急列車列車停靠，小部份區間普通列車亦會以此站為起訖站。
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| 74．賀來站 |
| 贺来站（日语：賀来駅／かくえき Kaku eki */?）位于大分县大分市，是九州旅客铁道（JR九州）的鐵路車站[1]。
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| 75．幸崎站 |
| 幸崎站（日语：幸崎駅／こうざきえき Kōzaki eki */?）是位於大分縣大分市大字本神崎，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920533[4]。是其中一個主要的區間車終點站，現時約有四成的班次是以本站起訖。早晚部分「日輪」及「音速」特急列車也會停站。
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| 76．坂之市站 |
| 坂之市站（日语：坂ノ市駅／さかのいちえき Sakanoichi eki */?）是位於大分縣大分市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。
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| 77．敷戶站 |
| 敷戶站（日语：敷戸駅／しきどえき Shikido eki */?）是位於大分縣大分市大字鴛野，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 78．下郡信號場 |
| 下郡信號場（日语：下郡信号場／しもごおりしんごうじょう Shimogōri-shingōjō */?）是一位於日本大分縣大分市、隸屬於九州旅客鐵道（JR九州）的鐵路設施，此信號場用作管理日豐本線支線（通往大分車輛中心）及豐肥本線的列車事宜，至於日豐本線列車，由於早在大分站出站後的轉轍器內已轉換，因此不會路經本信號場。
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| 79．瀧尾站 |
| 瀧尾站（日语：滝尾駅／たきおえき Takio eki */?）是位於大分縣大分市大字津守，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 80．竹中站 (日本) |
| 竹中站（日语：竹中駅／たけなかえき Takenaka eki */?）是位於大分縣大分市大字端登，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站。
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| 81．鶴崎站 |
| 鶴崎站（日语：鶴崎駅／つるさきえき Tsurusaki eki */?）是位於大分縣大分市，九州旅客鐵道（JR九州）和日本貨物鐵道（JR貨物）的日豐本線車站[1]。事務管號碼（日语：事務管理コード）為▲920530[3]。
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| 82．中判田站 |
| 中判田站（日语：中判田駅／なかはんだえき Naka-Handa eki */?）是位於大分縣大分市大字中判田，九州旅客鐵道（JR九州）的豐肥本線車站[1]。
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| 83．西大分站 |
| 西大分站（日语：西大分駅／にしおおいたえき Nishi-Ōita eki */?）是位於大分縣大分市大字生石，九州旅客鐵道（JR九州）和日本貨物鐵道（JR貨物）的日豐本線車站[1][3]。
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| 84．古國府站 |
| 古国府站（日语：古国府駅／ふるごうえき Furugō eki */?）位于大分县大分市，是九州旅客铁道（JR九州）的鐵路車站[1]。
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| 85．丰后国分站 |
| 丰后国分站（日语：豊後国分駅／ぶんごこくぶえき Bungo-Kokubu eki */?）位于大分县大分市，是九州旅客铁道（JR九州）的鐵路車站[1]。
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| 86．牧站 (大分縣) |
| 牧站（日语：牧駅／まきえき Maki eki */?）是位於大分縣大分市，屬九州旅客鐵道（JR九州）的日豐本線車站。車站位處大分鐵道事業部（日语：大分鉄道事業部）大分車輛中心的最東端[4]，是一個因通勤需要而設立的車站，為請願站。
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| 87．南大分站 |
| 南大分站（日语：南大分駅／みなみおおいたえき Furugō eki */?）位于大分县大分市，是九州旅客铁道（JR九州）的鐵路車站[1]。
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