| 1．长崎市 |
| 长崎市（日语：長崎市／ながさきし Nagasaki shi */?）是位於日本九州西部的都市，為长崎县縣治，也是日本西部重要的港灣都市。其歷史始於安土桃山時代對長崎港的開拓，在江戶時代的鎖國時期，更是日本唯一的國際貿易港口，與荷蘭、中國有密切的交流，並有外國人居住區出島[2]。因此長崎受到西方影響較深，擁有許多歐洲風格的建築，加上市區多坡道，使得長崎的都市景觀和大多數日本其他都市頗為不同。與西方交流的歷史，使得早期有許多傳教士隨著商船來到長崎，造成現在長崎成為日本基督徒人口比例最高的日本都市，天主教會在長崎亦單獨設有總教區[3]。也因為與中國的貿易往來，從江戶時期就有許多中國人居住於此，长崎新地中华街是日本三大唐人街之一。在第二次世界大戰末期，長崎市受到原子彈轟炸，成為繼廣島之後世界第二個、也是目前最後一個遭到核武器攻擊的都市。
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| 2．佐世保市 |
| 佐世保市（日语：佐世保市／させぼし Sasebo shi */?）是位於日本九州地區的西北端，長崎縣北部的城市，位於首府長崎市西北方偏北約50公里，為長崎縣內僅次於長崎市的第二大城市，目前也是中核市。
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| 3．島原市 |
| 島原市（日语：島原市／しまばらし Shimabara shi */?）為日本長崎縣東南部島原半島上的城市，為島原半島的主要都市。
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| 4．諫早市 |
| 諫早市（日语：諫早市／いさはやし Isahaya shi */?）是位於日本長崎縣中央的城市，人口為縣內僅次長崎市和佐世保市之第三大城市，也是九州第十四大城市。近年來該市面臨市街地空洞化的危機。
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| 5．大村市 |
| 大村市（日语：大村市／おおむらし Ōmura shi */?）為位于日本長崎縣中央部的城市；東部為多良岳縣立公園，西側面向大村灣。 長崎機場也位於此。
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| 6．平戶市 |
| 平戶市（日语：平戸市／ひらどし Hirado shi */?）是位于日本長崎縣西北部的城市，轄區主要位於平戶島，有部分轄區位於九州島北松浦半島的西北端，也因此成為在日本本土上最西端的城市。
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| 7．松浦市 |
| 松浦市（日语：松浦市／まつうらし Matsuura shi */?）是位於日本長崎縣北部北松浦半島的城市，北部面向伊萬里灣。以戰國時代的武士組織松浦黨的起源地而聞名。
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| 8．對馬市 |
| 對馬市（日语：対馬市／つしまし Tsushima shi */?）是隸屬日本長崎縣的城市，轄區為對馬島及附近島嶼，是日本最接近韓國的行政區劃，轄區內擁有陸海空三個自衛隊的基地。
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| 9．壹岐市 |
| 壹岐市（日语：壱岐市／いきし Iki shi */?）是一個隸屬日本長崎縣的城市，轄區包含壹岐島全島。
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| 10．五島市 |
| 五島市（日语：五島市／ごとうし Godō shi */?）是隸屬日本長崎縣，位於東中國海上五島群島西南部的城市。五島市成立于2004年8月1日，由福江市、南松浦郡富江町、玉之浦町、三井樂町、岐宿町、奈留町合併而成。
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| 11．西海市 |
| 西海市（日语：西海市／さいかいし Saikai shi */?）是位于日本長崎縣西彼杵半島北部的城市。於2005年4月1日由西彼杵郡北部的西彼町、大瀨戶町、西海町、大島町、崎戶町合併而成。
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| 12．雲仙市 |
| 雲仙市（日语：雲仙市／うんぜんし Unzen shi */?）是位于日本長崎縣島原半島東南部的城市，於2005年10月11日由南高來郡國見町、瑞穗町、吾妻町、愛野町、千千石町、小濱町、南串山町合併而成。
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| 13．南島原市 |
| 南島原市（日语：南島原市／みなみしまばらし Minamishimabara shi */?）是位於日本長崎縣島原半島南部的城市，於2006年3月31日由南高來郡加津佐町、口之津町、南有馬町、北有馬町、西有家町、有家町、布津町及深江町合併而成。
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| 14．長與町 |
| 長與町（日语：長与町／ながよちょう Nagayo chō */?）是日本長崎縣轄下的城鎮，位於長崎市市區東北方約10公里，屬西彼杵郡。
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| 15．時津町 |
| 時津町（日语：時津町／とぎつちょう Togitsu chō */?）是位於日本長崎縣的一個城鎮，屬西彼杵郡。
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| 16．東彼杵町 |
| 東彼杵町（日语：東彼杵町／ひがしそのぎちょう Higashisonogi chō */?）是位于日本長崎縣中部的城鎮，屬東彼杵郡。
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| 17．川棚町 |
| 川棚町（日语：川棚町／かわたなちょう Kawatana chō */?）是位于日本長崎縣中部的城鎮，屬東彼杵郡。
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| 18．波佐見町 |
| 波佐見町（日语：波佐見町／はさみちょう Hasami chō */?）是位于日本長崎縣中部的城鎮，屬東彼杵郡，目前是長崎縣內唯一不臨海的自治體。
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| 19．小值賀町 |
| 小值賀町（日语：小値賀町／おぢかちょう Ojika chō */?）是位於日本長崎縣西側的小値賀火山群島上的城鎮，屬北松浦郡。為日本最美麗的村莊聯盟成員之一。
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| 20．江迎町 |
| 江迎町（日语：江迎町／えむかえちょう Emukae chō */?）是位於日本長崎縣北部北松浦半島中央地區的城鎮，屬北松浦郡。
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| 21．佐佐町 |
| 佐佐町（日语：佐々町／さざちょう Saza chō */?）是位于日本長崎縣北部的城鎮，屬北松浦郡。被佐世保市所環繞。
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| 22．新上五島町 |
| 新上五島町（日语：新上五島町／しんかみごとうちょう Shinkamigotō chō */?）是位於日本長崎縣五島群島的城鎮，轄區以中通島、若松島為主，包括周邊的5個有人島、60個無人島[1]。目前是南松浦郡下唯一的地方公共團体，於2004年8月1日，由有川町、上五島町、若松町、新魚目町、奈良尾町5町合併而成｡
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